در صورتی که nginx بر روی سرور دارید برای رفع خطای Apache is functioning normally می بایست با دستور service nginx stop سرویس nginx را متوقف کنید و سپس به مسیر زیر بروید :
cd /usr/local/directadmin/custombuild
و سپس این دستور را اجرا کنید :
./build rewrite_confs
و برای رفع مشکلی که هم اکنون با آن مواجه هستید دستور های زیر را در ssh وارد کنید :
/etc/init.d/nginx restart
/etc/init.d/httpd restart
/usr/local/directadmin/scripts/disablenginx
/usr/local/directadmin/scripts/enablenginx
/etc/init.d/nginx restart
/etc/init.d/httpd restart
موفق باشید