سلام
شما موقع نصب centos می تونید پارتیشن بندی رو عوض کنید. نمی دونم مشکلتون چیه ولی توصیه اکید من اینه که از LVM استفاده کنید تا در آینده بتونید به راحتی روی سایز پارتیشن مدیریت داشته باشید:
A Beginner's Guide To LVM | HowtoForge - Linux Howtos and Tutorials