ببینید عزیز کانفیگ mysql ربطی به اینکه سیستم عامل کلاد لینوکس باشه یا چیز دیگه نداره . با توجه به نیازهای شما و مشخصات سخت افزاری سرور باید از پارامترهای خاصی درون فایل my.cnf استفاده بشه . اگر میتونید فایل کانفیگ این سرویس رو برای بنده خصوصی ارسال کنید تا یه نگاهی بهش بندازم .