custombuild 2.0 استفاده کنید.
هنلدر php بر روی fastcgi ست کنید و از nginx_apache نیز استفاده کنید.
اگر cms شما با php 7.0 ایراد ندارد از php 7.0 استفاده کنید در غیر این صورت php 5.4 پیشنهاد می شود.
بر روی nginx چک کنید حتما gzip و ***** cache فعال باشد
همچنین می توانید از کش هایی همچون apc , memcache , opcache استفاده کنید که پیشنهاد بنده memcache و opcache است.
تمامی مواردی که اعلام کردم از طریق custombuild قابل نصب و فعال سازی می باشند.