سلام
اگر از ماژول maxmind استفاده می کنید آنرا موقتا Deactivate کنید و پس از آن update کنید.
برای اطمینان خاطر ، ابتدا بکاپی که قبل از update گرفته اید را ریستور کنید و بعد از آن update کنید.
توجه کنید که قبل از ارتقا Privileges یوزر دیتابیس را روی All ست کنید تا مشکل دسترسی برای آپدیت بوجود نیاید.
ضمنا اگر از سرور ضعیفی برای میزبانی سایت خود استفاده می کنید مقدار max_execution_time را نیز عدد بالایی ست کنید.