مشکل شما از کش شدن رم نیست !
لینوکس به صورت پیشفرض رم را کش میکند و هر زمان که مورد نیاز باشد انرا جهت استفاده خالی میکند (رم کش شده)
لینک زیر را مشاهده کنید :
Help! Linux ate my RAM!
------------------------------------
مشکل شما استفاده بیش از حد رم توسط نرم افزار های روی سرور هست !
بدون بررسی دقیق نمیتوان علت انرا پیدا کرد.

موفق باشید./