از Cpanel خود وارد phpMyAdmin شوید.

پس از ورود به phpMyAdmin دیتا بیس که می خواهید optimize کنید را انتخاب نمایید.
گزینه Check All را برای انتخاب تمام Table های دیتا بیس فشار دهید.
از منوی With selected گزینه Optimize table را انتخاب کنید.
کمی صبر کنید تا دیتا بیس Optimize شود.