برای نصب ioncube مراحل زیر را دنبال کنید :
1. با دسترسی root به SSH متصل شوید.
2. خارج نمودن فایل از حالت فشرده اگر فایل در حال فشرده است بوسیله‌ی فرمان زیر :

tar -zxf ioncube_loaders_lin.tar.gz
نکته : ممکن است شما نیاز به نسخه‌ی دیگری از ioncube داشته باشید، نام فایل وابسته به نسخه ای میباشد که دانلود نموده اید.
3. پوشه‌ را بوسیله‌ دستور زیر به مسیر ماژولهای PHP منتقل نمایید :

mv ioncube /usr/lib/php/modules
نکته : در صورتی که از نسخه‌ سیستم عامل شما ۶۴ بیتی می باشد ، بجای lib از lib64 استفاده نمایید.
4. خط زیر را در انتهای فایل php.ini اضافه نمایید :

zend_extension=/usr/lib/php/modules/ioncube/ioncube_loader_lin_5.1.so
5. Apachi را با استفاده از دستور زیر Restart نمایید :

service httpd restart
6. با استفاده از دستور زیر صحت نصب را کنترل کنید :
php -v