مشکل اینجاست که مسیر قرار گیزی اون فایل که گفتم با آدرسی که در php.ini تعریف شده یکسان نیست!

یا ورژن جدید تر اون فایل تو سیستم شما وجود داره

این فایل رو پیدا کنید و یینید کجای سرورتون هست، مسیرش رو تو php.ini درست کنید.
zend_extension=/usr/local/lib/ioncube_loader_lin_5.3.so
zend_extension=/usr/local/lib/ZendGuardLoader.so