به لحاظ کارکردی فکر نکنم با هم فرق داشته باشن
نسخه سیتریکس رو میشه به صورت یه پروژه آماده نصب شده رویلینوکس دید که اگر درست بدونم مبتنی بر لینوکس فدورا است
ولی شما می تونید xen رو روی هر توزیعی نصب کنید در ضمن تو نسخه سیتریکس شما یه کنسول مدیریت به نام xen center دارید که روی xen این کنسول وجود نداره