دو نسخه رو باید دستی کامپایل کنید و در دو جای مختلف قرار بدید. سپس برای هندلر آپاچی برای هر virtual host باید فایل باینری مربوطه رو در apache config بنویسید.
اینجا روش رو گفته: Brettic.us Blog Archive PHP 5.2 and 5.3 side-by-side on Apache and Ubuntu 10.10
این رو هم ببینید و وب سایت ها رو آپگرید کنید :
PHP: Backward Incompatible Changes - Manual