سلام
بله kloxo از Apache و NginX و LigHTTPD و LiteSpeed پشتیبانی میکنه و علاوه بر اینها بصورت Reserve P-roxy هم همینطور.
فایل های htaccess هم همینطور

-----------------
برای ویندوز هم zPanel مناسب هست که Apache و .htaccess پشتیبانی میکنه