با سلام
فایل my.cnf شما می شود بهتر تنظیم کرد.
ابتدا بهتر است شما swap رو بر روی ۴ گیگ تنظیم کنید.
نیازی به وب شل نیست و شما می توانید با csf این موارد را کنترل نمایید.
اجالتا برای رصد کردن می تونید از آموزش زیر استفاده نمایید.
Linux Check Memory Usage
با تشکر