با سلام...
رمز عبور سیستم عامل چه ویندوزی چه لینوکسی قابل bypass کردن هست.
البته سرویس دهند ها نقدر بی کار نیستند که بخوان دونه دونه سرورهای مجازی رو بارسی کنند. اما برای اطمینان می تونید از نرم افزارهای encryption استفاده کنید... اما اگر کد هست قاعدتا روی سرور در حال اجرا هست و نمیشه encrypt کرد.