باید از مسیر زیر
/usr/local/directadmin/custombuild
فایل options.conf را ویرایش و نسخه mysql را برروی 5.5 بزارید و پس از ذخیره , با استفاده از دستور build mysql نسخه 5.5 را نصب کنید .
البته لازم به ذکر هست که پس از آپگرید/دانگرید mysql نیازمند rebuid کردن php هم هستید .