مشکلی بوجود نمیاد.
اگه Full backup د اشته باشی هم با دسترسی کنترل پنل و هم ssh می تونی بازگردانی رو انجام بدی.
فایل های رو می ریزی تو public_html و دیتابیس رو هم از phpmyadmin می تونی بازگردانی کنی