این دستورات اسکریپت های سی پنل هستند و کاری با وب سرور شما نداره
مثلا دستور
/scripts/enablefileprotect
باعث برای ست کردن پرمیشن ها مثل
wwwaccts.conf عمل میکنه در دایرکتوری های /home/users

دستور دوم
/scripts/chownpublichtmls
برای تنظیم دسترسی پوشه های public_html و ریست به حالت پیش فرض عمل میکنه همون کاری که کامند chown انجام میدهد

و...