با سلام
بیشترین مشکل مربوط به سایت هایی که از zend استفاده می کنند.
در php5.2 از zend optimizer استفاده می شود در حالی که در php5.3 از zendguard استفاده می شه.
در بقیه موارد مشکل خاصی نیست.