طبق این عکسی که زدین cpu usage بالاست ولی مموری یوزیج پایینه و لود هم خیلی بالا نیست .
مصرف بالای سی پی یو هم کاری به آپاچی نداره ( طبق تصویر )
شما اول میزان منابع مصرفی در mysql رو بهینه کنید . در کنار این موراد از apc یا xcache هم در php استفاده کنید . zend optimizer هم اگر 5.2 دارید استفاده کنید .