ریبویلد آپاچ
my.cnf برای سرور دیتابیس رو کانفیگ کنید و بهینه سازی کنید
البته اینا ربطی به مباحث امنیتی نداره و بحث بهینه سازی هست .

اولین قدم برای افزایش امنیت طبقه بندی اهمیت برای شماست .

آیا سرور شما بیشتر از طریق منابع اصلی هدف ممکنه قرار بگیره یا سایت هایی که میزبانی میکنید ؟
امنیت از سمت سایت ها که در لایه اول مرتبط با سیستم مدیریت محتوا در لایه دوم محیط اجرای این کدهای نوشته شده است .

امنیت از سمت سرور چند دسته داره .
اولین قدم این هست که مسیر رایج ترین دسترسی رو ببندید ( ssh )
سرویس هایی که به صورت ریموت آسیب پذیر هستند را محدود کنید ( مثل dns )
سرویس هایی که بهشون نیازی ندارید رو غیر فعال کنید ( مثل NFS و یا avahi )

موارد بسیار زیادی هست که به تدریج براساس رفتار وب سایت ها و بازدیدکنندگان آنها باید اعمال بشن .
مهمترین بخش هم امنیت شبکه است که معمولا رعایت میشه در دیتاسنتر ها