من متوجه منظورتون نشدم.

ولی در suPhp فایل مربوطه در مسیر زیر قرار دارد.
کد:
 /usr/local/etc/php5/cgi/php.ini
همیچنین برای پیدا کردن مسیر php.ini فعال از دستور زیر میتوانید بهره بگیرید
کد:
php -i | grep php.ini
همچنین برای سفارشی و یا نصب ماژولهایی مثل soap باید فایل زیر را ویرایش کنید
کد:
/usr/local/directadmin/custombuild/configure/suphp/configure.php5
امیدوارم مشکلتون همین بوده باشه.