همانطور که دوستمان RezaFH اشاره کرده، دلیل عمده اش اینه که قطعات کیس سرور برای کارکرد 24/7/365 طراحی شده اند و لذا کیفیت بالاتری دارند. این مطلب به خصوص در طراحی قطعات متحرک معنی پیدا می کنه. مثلا فن های یک کیس خوب سرور (بخوانید سوپرمایکرو!) بالبیرینگ های دوگانه دارند که باعث می شه فن ها بیش از 5 سال کار مداوم را دوام بیاورند. در حالی فن های دسکتاپ در شرایط کار مداوم در دیتاسنتر شاید چندماه بیشتر دوام نیاورند.
دلیل دیگه این است که چون تقاضا برای کیس سرور خیلی کمتر از دسکتاپ است تعداد واحد تولید شده کمتر و درصد سودی که تولید کننده و توزیع کننده از هر واحد می طلبند بیشتر و در نتیجه هزینه نهایی بیشتر می شود.