سلام
توسط کامند زیر :

کد:
mysql -u username_database -p name_database < backupname.sql
از طریق SSH اقدام به ریستور دیتابیس کنید

شاید چند درصد مربوط به گزینه :
کد:
PHP max upload size
نیز باشد که در بخش :
کد:
                 Main >> Server Configuration >> Tweak Settings
در زیرمجموعه :
php
قرار دارد

اما از طریق SSH بسیار ساده تر است


یک نکته :
وقتی شما میزان :
کد:
max_allowed_packet
را مثلاً قرار میدهید :
کد:
max_allowed_packet = 10G
بعد از ذخیره باید سرویس mysql را یک بار ریست کنید

موفق باشید