سلام
از این پیوست ها میشه نتیجه 100% رسید که چیزی تحت عنوان Slow Query باعث این مشکل نیستش .

نظر بیشتری هم نمیشه داد چون اطلاعاتی در دست نیست .

در ضمن یه نکته عجیب، تو شاخه‎ی /var/log/ فایلی به اسم messages موجود نیست !
این مسیر رو دنبال کنید و این فایل رو به دلخواه تنظیم کنید : /etc/rsyslog.d/50-default.conf

مثال :
کد:
*.=info;*.=notice;*.=warn;\
auth,authpriv.none;\
cron,daemon.none;\
mail,news.none -/var/log/messages

daemon.*;mail.*;\
news.err;\
*.=debug;*.=info;\
*.=notice;*.=warn |/dev/xconsole
پس از اون sudo restart rsyslog جهت رست rsyslog .

موفق باشید .