سلام
اگه بحث امنیت باشه که هر 2 تا یعنی هم ویندوز هم لینوکس اسیب پذیرند درسته ویندوز بیشتره ولی به هرحال میشه جلوش رو گرفت
بیشتر بحث زبان برنامه نویسی هست این نکته رو بگم که سطح دسترسی فایل ها فرمش در ویندوز و لینوکس خیلی فرق داره اسکریپت هایی که با php نوشته میشن نصفشون تو پنل ها مخصوصن اونایی که از وب سرور iis استفاده میکنند با پنل پلسک اصلا کار نمیکنه ولی برای asp که زبان قدرتمندی هست و قدرتش با php در یک سطح هست خوب ویندوز عالیه و اصلا ساپورتشون ویندور هست
و یکی از دلایل مهمی که بیشتر از php استفاده میکن بحث قدمت این زبان هست من فک میکنم قدرت 2 تاشون در یک سطح باشه
موفق باشید