خب ببینید cpu به صورت اشتراکی هست
اگر بقیه vps ها فشار بیارند روی vps شما هم تاثیر میزاره !!!
شاید اصلاً vps شما هیچ !!!! مشکلی نداشته باشه

البته لاگ ها رو هم چک کنید بد نیست ، ممکنه یکی از سایت ها زیر Ddos باشه ( که روی رم هم فشار میاره )
یا اینکه هارد پر باشه
یا خیلی دلائل که نمیشه همشو گفت و بهترین راه اینه که شما لاگ ها رو بخوانید