این تنظیماتی که برای my.cnf گذاشتید متناسب نیست mysqltuner.pl را اجرا کنید خروجی را اینجا بزارید تا بگم مقادیر را به چی تغییر بدید.
لطفا خروجی را داخل تگ code بزارید.

داخل top مقدا iow را بنویسید ، داخل فایل slow query ببنید کدام کوئری بیشتر تکرار شده اینجا بزارید یا اینکه داخل لیست کوئری ها ببنید کدوم کوئری بیشتر از 5 یا 10 ثانیه طول میکشه و اینجا بزارید