اگر از php 5.3 استفاده می کنید می تونید امکان تغییر پارامترهای php.ini رو برای همه ببندید و برای اکانتهای مختلف فایلهای مختلف php.ini داشته باشید که فقط توی کنترل شما باشند.
آموزش مربوطه رو از cpanel بخونید:
Methods to Increase Security on suPHP - Restricting who can use php.ini files






پاسخ با نقل قول