همانطور که Online24 گفتند Safemode در تامین امنیت پی اچ پی بسیار موثر است
البته هاستینگ های بزرگ جهان از Safemode استفاده نمیکنند و بصورت بسیار تخصصی PHP را Optimiz میکنند
اگر تخصص امن کردن PHP و Optimize کردن آن را ندارید روشن کردن Safemode شدیدا توصیه میشود(امن کردن PHP به Disable Function خلاصه نمیشود)
در ضمن توصیه میکنم این تاپیک را هم مشاهده کنید
http://www.webhostingtalk.ir/f55/25551/#post243604