nginx هم مشکلات خاص خودش رو داره و اگه به تنهایی استفاده بشه فرق آنچنانی با apache نمیکنه.
اگرم هردو با هم نصب بشن دوتا وب سرور از لحاظ امنیتی مشکل سازه و در آمار بازدید بالا apache کم میاره و باز هم مشکلاتی بوجود میاد و باید باز هم apache حرفه ای تر کانفیگ بشه.
در کل دردسره