فکر کنم شما cPanel تون به درستی نصب نشده , باید با پشتیبانی سی پنل تماس بگیرید و بخواهید مشکلات رو حل کنند .

در مورد سوال دوم برای تغییر نسخه mysql باید به MySQL Upgrade برین در سی پنل و این کار رو انجام بدین .