خب لاگ mysql رو ببینید قاعدتا اگر از mysql باشه تو لاگش میزنه . این دستور لاگ رو به صورت realtime به شما نمایش میده داخل ssh
tail -f /var/log/mysql/mysqld.log
البته مسیر لاگ رو بعضی افراد جاهای دیگه هم میزارن .
اگر مشکل از دیتابیس ها باشه که باید slow_log بزارید و اون slow_log رو مانیتور کنید .