بله مشکلی توی نصب کنار ویندوز هست ولی توجه داشته باشید ابتدا ویندوز باید نصب شده باشه و بعد FREE BSD چون بوت لود ویندوز کلا توزیع های لینوکس و free BSD را نمیشناسد.
در ضمن هنگام نصب پارتیشن بندی اتوماتیک را انتخاب نکنید
بهتره به صورت دستی پارتیشن بندی کنید 3 پارتیشن به ترتیب روت / - swap - /home درست کنید. سایز Swap را ۲ برابر رم سیستم یا سرور خود بگزارید