باسلام،
شما با PHP هم می توانید کد نویسی یا عملیات های غیر همزمان با کال بک و .. انجام بدهید، پروژه های HHVM , ReactPHP, AMP را بررسی کنید. اگر به درستی استفاده شود به صورت محسوس و باور نکردنی سرعت را احساس خواهید کرد اما خب بیشتر برنامه نویس ها چون فکر می کنند PHP به صورت ناتیو چیزی برای این کار ندارد، سراغ ـش نمیرن و سخت در اشتباه هستند.
در مورد بنچمارک ها به نظر من فقط بنچمارک هایی که سرعت خواندن و نوشتن فایل، مقدار دهی آرایه، عملیات های محاسباتی و .... دو تا زبان را محاسبه کردند معتبر است، در غیر این صورت سمت PHP باید وب سرور asynchronous و event‑driven باشد (مثل nginx) و اسکریپت هم اگر در حَد echo نیست سمت PHP هم thread باید non-blocking باشد (asynchronous نوشته شود)، اگر به این صورت نباشد نتایج کاملا فرق خواهد داشت. اما خب با این تفاسیر 99% بنچمارک ها به ما میگن Node سریعتر است.
در مورد سایت های spa به علت توانایی راه اندازی یک پروژه isomorphic (رندرگیری سمت سرور و کاربر تمام با جاوا اسکریپت) Node ایده آل شده است اما به این معنی نیست نمی توانیم یک پروژه رندرگیری فقط در سمت سرور پیاده کنیم، شما با express می توانید مسیر یابی کنید و هرچی که می خواهید رندر کنید.
در کل یادگیریش عالی و پیشنهاد می شود با توجه به نیاز پروژه می توانید انتحاب کنید، اگر خودم بخواهم یک پروژه با angular یا react و isomorphic پیاده کنم صد در صد سراغ Node خواهم رفت یا اگر نیاز به یک ارتباط real-time داشته باشد هیچ زمان PHP را انتخاب نمی کنم.