سلام،
داخل /etc/my.cnf چک کنید دایرکتوری سوکت رو. باید یه چیزی شبیه
کد PHP:
socket=/var/lib/mysql/mysql.sock 
باشه. اگر نیست من باشم تغییر نمیدم الان چون مورد داشتیم بعد از ریبوت باعث دیتا لاس شده... فقط چک کنید ببینید همینه یا نه؟
کنترل پنل دارید؟ اگر دارید یک بار آپگرید کنید احتمالا اوکی میشه. توجه داشته باشید آپگرید دیتابیس به طور کلی امن هست ولی این امن بودن 100% نیست و همیشه احتمال دیتا لاس هست.

با احترام.