سلام،
برای این که از راه زیر استفاده کنید.
فایل crontab رو ادیت کنید و بگید هر چند دقیقه یا مثلا در زمان های خاصی دستور reboot رو اجرا کنه.
کد PHP:
nano /etc/crontab 
هم چنین می تونید برای تمیز تر بودن کار، فایلتون رو به داخل /etc/cron.d انتقال بدید که crontab شلوغ نشه.

با احترام.