سلام
هر دو راه خوب هستش ولی وابسته به شرایطی هستش که شما دارید.
گزینه اول شما 3 تا وب سایت و 3 دیتابیس دارید که روی یک هاست هستش و حجم داده ها 3 برابر میشه که اینجوری باید به فکر یه هاست قوی باشی که وقتی تعداد پست و صفحات وب سایت ها زیاد شد کم نیاره
ولی در عوض شما 3 تا بک آپ از اطلاعات دارید که اگر احیانا یکی از اونها به هر دلیلی خراب شه شما جایگذین دارین. از نظر سئو هم چون مطالب به صورت جدا از وب سایت های دیگه هستش و شما میتونید برای هرکدومشون یه تغییرات جزئی ایجاد کنید تا گوگل امتیاز منفی به سایت ها نده و این خوبه.
گزینه دوم از نظر اقتصادی هم به صرفه تر هستش چون شما از یک پایگاه داده برای 3 وب سایت استفاده میکنید ولی اینجوری باید به فکر بک آپ جدا باشید که اگر به هر دلیلی دیتابیس شما خراب بشه شما کل اطلاعاتتون رو از دست میدین. وو از نظر سئو هم قطعا امتیاز منفی از گوگل کسب میکنی.
در مورد افزونه هم میتونید از افزونه های vaultpress , backwpup برای بک آپ استفاده کنید.