تنظیمات mysql در همین فایلی هست که محتویات آن را نشان قرار دادید . در مسیر /etc/
my.cnf

پیغام
Too many connections به دلیل زیاد بودن تعداد کانشکن های سایت شما از 200 کانکشنی هست که در فایل my.cnf در عبارت max_connections = 200 محدود کردید .

می توانید این مقدار را 50 تای دیگر افزایش دهید ، سرویس mysql را ریستارت کنید و دوباره لاگ چک کنید .
اما راه اصولی تر این هست که تنظیمات mysql متناسب با درخواست های سایت شما بهینه سازی شود .