لطفا اطلاعات my.cnf رو قرار بدید
همچنین دستورات زیر رو به ترتیب اجرا کنید
service mysql stop
mysqlcheck --auto-repair --optimize --all-databases

- - - Updated - - -

البته بعد از انجام شدن اپیمایز دوباره استارت کنید Sql رو
service mysql start