سلام
1- تعداد آی پی هایی که کانکت شدن رو ببینید تا مطمئن شید زیر حمله ddos نیستید(دستور زیر)
netstat -anp |grep 'tcp\|udp' | awk '{print $5}' | cut -d: -f1 | sort | uniq -c | sort -n
2- با زدن دستور top ببینید چه پروسس هایی رم رو دارن بیش از حد مصرف میکنن اگر بهشون نیاز ندارین اون سرویس یا ... رو استاپ کنین
3- از کش شدن رم جلوگیری کنید (دستور زیر)
echo 3 > /proc/sys/vm/drop_caches
اگه مشکلتون با هیچ کدوم از اینا حل نشد پیشنهاد میکنم سرورتون رو ارتقا بدین