سلام
دایرکتری public_html حذف کنید(محتویات سایتتان را در /var/www/html قرار دهید)
برای تنظیم دامین باید dns server نصب کنید که معروف ترین ان برای لینوکس bind هست که به وسیله اون باید zone تعریف کنید و ...
یک روش ساده تر هم اینکه از سرویس هایی مثل cloudflare,cloudns ,... استفاده کنید و سپس main ip برای دامین را رکورد A ای پی سرور قرار دهید(االبته در این روش امکان مدیریت کامل دامین در سرور ندارید.)
موفق باشید
همین لینک مرجع خوبیه برای bind
شما میتونید توی سایتهایی که دوستمون فرمودند عضو شید، دامینتون رو ادد کنید، نیم سرورهای دامینت رو به اون سریسا تغییر بدی و از سرویس دی ان سرور اونا استفاده کنید