لیمیت های اپاچی و php و mysql هستش .

کی کانفیگ کرده سرور رو ؟ خودتون ؟ اگر خودتون نبوددید به کانفیگرتون اطلاع بدید ( البته اگر کسی کانفیگ کرده و شما دستکاری نکردین .. )

log رو هم میتونین چک کنین که دقیقا چرا 500 میده و در همون حدود باعث طول کشیدن هم همونه ...

سی پنل : tail -f /usr/local/apache/logs/error_log
...

قبل از اینجام اینکارا موقتا اپاچی رو مستقیما روی پورت 80 ران کنین که اینجینکس بره کنار موقتا ... تست کنید