CustomBuild 3 وجود ندارد. احتمالا منظور شما گزینه سوم است که CustomBuild 1.2 است.
CustomBuild 1.2 پیچیده تر از CustomBuild 2 است. توصیه می کنم یا سرور رو مجدد با CustomBuild 2 کانفیگ کنید یا با استفاده از آموزش زیر به CustomBuild 2 ارتقا دهید.
http://help.directadmin.com/item.php?id=555
در فایل options.conf هم می توانید مقادیر مناسب را تنظیم و build کنید.
در مورد عملکرد و سازگاری سرویس ها هم می توانید از لینک زیر استفاده کنید.
https://forum.directadmin.com/showthread.php?t=44743