درود
دوست عزیز جای نگرانی نیست چون این ضعف CSF هستش که جز مسیر /usr/local/lib/php.ini نمیتواند مسیر دیکگری تشخیص دهد. وقتی شما php-fpm با fastcgi نصب میکنید مسیر تغییر میکند اما csf تشخیص نمیدهد و مهم هم نیست شما تغییراتتونو اعمال کنید به اون ارور توجه نکنید
ارادت