سلام

این مشکل می تونه از چند چیز باشه

1- تنظیمات نادرست php.ini در حین کانفیگ . ( php.ini رو به حالت برگردونید و مقدار رم رو 120 مگ بگذارید و تمامی مواردی که به خاطر امنیت در php غیر فعال کردید بردارید )
2- ا تفاوت نسخه های php .( بهتره از نسخه 5.3.29 php استفاده کنید سازگاری بیشتری با اسکریپت ها داره .)
3- چند گزینه ضروری زمان rebuild apache از یادتون رفته و روی php نصب نشدند (که باید دوباره انجام بدید.)
4- php به جای suphp بودن روی DSO یا cgi تنظیم شده باشه ( از suphp بودن تنظیمات php مطمئن شید.)