در کل میشه CSS رو در دیتابیس ذخیره کرد و ب صورت file.php?stylename.harchi هم فراخوانیش کرد . (روشی ک کمتر میبینید !)
البته سایتی ک شما لینک دادید ، css ها رو combine میکنه تحت عنوان یک رشته srting بصورت random کاراکتر و عدد ...
برای حذف پسوند .css هم روش های زیادی هست ، مثل فراخوانی تحت عنوان .php یا حذف پسوند با استفاده از اچ تی اکسس و...