احتمال این که بشه دیتا رو بدون ibdata برگردوند خیلی کمه . ولی در صورت نیاز لطفا نسخه سیستم عامل / نسخه mysql و دسترسی را ارسال کنید تا بررسی کنم .

دستوری که باعث حذف اون فایل شده رو هم بفرمایید . touch شده یا rm ؟