این سوالتون خیلی کلی هست و اگر آشنایی با php ندارد از پایه سوال قابل پاسخ نیست؛
جهت باگ زدایی باید مهارت و تخصص کافی در php داشته باشید؛اگر این اصل رو ندارید اصلا پیگیر این قضیه نشید و از یک فرد آشنا به php کمک بگیرید، الته این در خصوص اسکریپت های کوچک کاربرد دارد و در خصوص اسکریپتی مثلا هم اندازه وردپرس ؛ نیاز به صرف زمان بالا و چند ماهه و تخصصی می باشد.
(اصولا اگه باگ به راحتی قابل پیدا شدن و رفع شدن بود مطمئانا نویسندگان اون اسکریپت این کار رو انجام می دادند.)
متاسفانه مورد دیگه ای که
خیلی دیده میشه سپردن سایت به تیم های ( مثلا) امنیتی می باشد که سایت را در نیم ساعت یا یک ساعت چک می کنند که باگ نداشته باشد !
که یکی از طنز ترین موارد امنیت است.