درود

دوست عزیز مشکل فوق به موارد زیادی بستگی دارد
تعدادی از موارد فوق:

1- پر شدن هارد سرور
2- مشکل در permission ها و ownership پوشه mysql
3- عدم تنظیم مقادیر صحیح در فایل کانفیگ mysql
4- crash کردن تیبل های innodb
و..

باید بررسی شود تا مشکل مشخص شود