سلام
اگر بخواهید با دستور این کار رو بکنید میتوانید به راحتی با دستور mv جا به جا کنید و با cp کپی کنید(سرچ کنید پیدا میکنید)
همچنین با sftp هم میتونید به راحتی فایل ها رو مدیریت کنید (با ftp فرق داره باید با پورت و رمز ssh وارد بشید)
همچنین اگر به دنبال رابط کاربری گرافیکی هستید میتونید vncserver و یک دسکتاپ سبک نصب کنید و راحت مثل ریموت دسکتاپ ویندوز وارد سرور بشید و با سرور کار کنید (از مدیریت فایل ها تا مرور گری وب و ... )
موفق باشید